人工智能预测超过2亿种蛋白质结构

据英国杂志《新科学家》网站近日报道，总部位于英国的人工智能公司Deep Thinking宣布将公布超2亿个蛋白质的结构。在短短18个月内，该公司用“阿尔法折叠”算法预测了迄今为止几乎所有编目的蛋白质的结构，解决了生物学领域最重要的挑战之一，这将有助于应对抗生素耐药性，加速药物开发，并彻底改变基础科学。

几十年来，根据氨基酸序列确定蛋白质的形状一直是生物学领域的一个难题。2020年底，“深度思考”宣布公司的“阿尔法折叠”算法可以准确预测折叠蛋白质的结构；到2021年年中，这种人工智能已经能够提取人体内98.5%的蛋白质。最近，该公司宣布将公布超过2亿个蛋白质的结构，几乎所有这些蛋白质都列在全球公认的蛋白质研究文库UniProt中。

Deep Thinking还在与欧洲分子生物学实验室下属的欧洲生物信息学研究所合作，创建一个可搜索的数据库“阿尔法折叠蛋白质结构数据库”。研究人员可以轻松自由地访问相关信息，使搜索蛋白质结构几乎像网络搜索工具一样简单。

许多科学家正在使用“阿尔法折叠”来促进许多领域的研究。例如，牛津大学的马特希金斯(Matt Higgins)等人正在研究一种他们认为是中断疟原虫生命周期关键的蛋白质，希望开发出一种有效的疟疾疫苗；一些科学家还利用它来设计新的酶来分解塑料垃圾，并了解更多关于使细菌对抗生素产生耐药性的蛋白质。

伦敦帝国理工学院(Imperial College London)的基思威廉姆森(Keith Williamson)表示，“阿尔法折叠”改变了生物学研究，但仍存在一些问题，如无法提取任意氨基酸序列并准确模拟它们的折叠模式，无法揭示蛋白质之间复杂的相互作用。此外，其准确性也有待提高。

“深度思考”表示，目前正在致力于提高这一工具的准确性，以进一步了解蛋白质是如何产生的，细胞是如何工作的。